La colección Cites del Museo de Historia Natural de Valparaíso es un conjunto único, pues no forma parte de la exhibición permanente ni tiene un carácter patrimonial. Su objetivo es resguardar que los convenios de protección de flora y fauna silvestre suscritos por Chile se cumplan y respeten.
Cites provee un marco normativo a los países firmantes que les permite disponer de los ejemplares confiscados. En el caso de Chile, los animales vivos se entregan a centros de rescate y rehabilitación, y a espacios de exhibición como el Zoológico Metropolitano. Los ejemplares muertos ingresan a lugares de investigación y educación, como los museos de historia natural.
La galería que se muestra a continuación se compone de fotografías de animales o partes de ellos que han sido requisados por el Servicio Agrícola Ganadero y hoy forman parte del depósito legal del Museo.