El Museo de Historia Natural de Valparaíso fue creado por el educador Eduardo de la Barra el año 1878, en dos salas del Liceo de Hombres de Valparaíso, que permitieron el desarrollo del segundo museo más antiguo de Chile y el primero regional. Ya en el año 1879, el MHNV contaba con una biblioteca científica que poseía 300 volúmenes de obras clásicas, de las ciencias naturales y antropología, a lo que se sumaba una interesante colección de especies de flora y fauna colectadas o donadas por la sociedad porteña.
El violento terremoto que azotó a Valparaíso en 1906 y el incendio posterior que destruyó al liceo, afectó irreparablemente a las valiosas colecciones que el museo había logrado acumular. Período en que su director Carlos Porter Mosso realiza una importante labor en la gestión de nuevas colecciones, producción de ensayos en el ámbito de las ciencias, la zoología, la antropología, así como la fundación de la Revista Chilena de Historia Natural.
En 1914, se logra reorganizar nuevamente la institución, gracias al apoyo de ilustres ciudadanos de Valparaíso, quienes donan importantes colecciones y obras científicas para su biblioteca., periodo en que emerge la figura de otro director, John Juger Silver, entusiasta impulsor de la re apertura del museo en Valparaíso, su vínculo con la institución, se remonta al año 1904 cuando comenzó su trabajo como jefe de botánica, alcanzando la dirección del museo el año 1910. Fundamental resulta su legado siendo él responsable de reconstruir al museo. Para ello, tras un arduo trabajo y gestión, consigue el arriendo de una nueva sede del museo en el sector de Playa Ancha de Valparaíso, logrando su apertura definitiva para la comunidad el año 1914. Durante la gestión de Juger Silver se organizan las nuevas colecciones; el desarrollo de áreas especializadas de trabajo e investigación, como es el caso de la biblioteca científica o el desarrollo del laboratorio de taxidermia, a cargo de otro personaje histórico, José Carpeneto.
Por carecer de un edificio propio, el museo debe cambiarse periódicamente de sede, ocupando locales en la avenida Gran Bretaña y la ex-Feria del Mar, en Playa Ancha; una pequeña casona en Viña del Mar y finalmente, el 15 de noviembre de 1988, gracias a un Comodato acordado entre la Dirección de Bibliotecas, Archivos y Museos (Dibam), y la Ilustre Municipalidad de Valparaíso, el museo se reinaugura en el Palacio Lyon, obra del arquitecto y constructor Carlos Von Moltke, lo cual junto con permitir su retorno a su ciudad de origen, pone en valor este edificio declarado Monumento Histórico el año 1979.
Posteriormente, tras diez años de gestión y producción, gracias al Plan Nacional de Mejoramiento Integral de Museos Regionales, el Museo de Historia Natural de Valparaíso fue completamente renovado, marcando un hito museográfico con su re inauguración en noviembre del año 2014; logrando así concretar una nueva dinámica en la gestión, vinculada con la comunidad, involucrando la restauración del inmueble, su infraestructura, equipamiento y museografía.
Conjuntamente a esta mejoría del espacio museal, el estado de Chile anuncia la gratuidad de ingreso, desde marzo del año 2015, a los museos dependientes del Servicio Nacional del Patrimonio Cultural, que se relaciona con el gobierno de Chile a través del Ministerio de las Culturas, las Artes y el Patrimonio, , medida que abarca a 27 recintos en 13 regiones del país.
La actual exhibición permanente del museo "Biodiversidad en la región de Valparaíso", presenta al público, un renovado diseño de su museografía, con nuevas ambientaciones que invitan a la interactividad de forma lúdica, educativa y dinámica, dando cuenta del patrimonio, la historia y la naturaleza presente en la región central de Chile.
Muestra conformada por más de 700 objetos museables, que incluyen piezas húmedas, taxidermizadas, plastinadas y réplicas, que dan cuenta en parte, de las colecciones conservada en los depósitos del museo; piezas obtenida por medio de donaciones históricas, destacando las área de biología, arqueología y patrimonio histórico. El trabajo de la institución se rige por los convenios internacionales sobre protección y manejo de biodiversidad a los que el Estado de Chile suscribe.
El Museo de Historia Natural de Valparaíso posee una fuerte tradición en la protección, investigación y difusión del patrimonio natural y cultural que alberga, sus colecciones incluyen variadas piezas, desde invertebrados a vertebrados mayores; como también materiales líticos a piezas arqueológicas; etnográficas e históricas, incluyendo restos bioantropológicos resguardados y conservados, con la autoridad y responsabilidad que el museo representa, designado como autoridad científica y deposito legal en la región de Valparaíso.
Directores del Museo
Dr. Edwin Reed Brokman: 1878 - 1879
Dr. Federico Puga Borné: 1879 - 1883
Clodomiro Perez Canto:1883 - 1897
Rafael Campusano: 1897 - 1897
Carlos Porter Muso: 1897 - 1910
John Juger Silver: 1910 - 1968
Nina Ovalle: 1968 - 1972
Eduardo Brousse Soto: 1972 - 1979
Ana Avalos Valenzuela: 1979 - 2008
Cristian Becker Álvarez: 2008 - 2009
Patricio Ortega Gómez: 2009 - 2013
Loredana Rosso Elorriaga: 2013 - 2019
Sergio Quiroz Jara: 2020 a la fecha
